Подскажите, какие у кого есть химические программы для Linux (рисовалки, трехмерное моделирование, смотрелки и т.д.) У меня уже есть XDrawChem, Chemtool, Jchempaint, Marvinsketch, Jmol, Chimera, Ghemical. Однако хотелось бы побольше. Заглядывал на сайт Linux4Chemistry, но там все на английском (не владею!), да и пробовать их все долго, так что лучше спрошу здесь.
OS-Mopslinux 5.1 (скоро перейду на 6)
Последние комментарии
-
OlegL, 17 декабря 2023 года в 15:00 →
Перекличка
21
-
REDkiy, 8 июня 2023 года в 9:09 →
Как «замокать» файл для юниттеста в Python?
2
-
fhunter, 29 ноября 2022 года в 2:09 →
Проблема с NO_PUBKEY: как получить GPG-ключ и добавить его в базу apt?
6
-
Иванн, 9 апреля 2022 года в 8:31 →
Ассоциация РАСПО провела первое учредительное собрание
1
-
Kiri11.ADV1, 7 марта 2021 года в 12:01 →
Логи catalina.out в TomCat 9 в формате JSON
1
ecobeing.ru
Экология и вегетарианство на благо всем живым существам Планеты.
http://www.nixp.ru/soft/science_chem
P.S. Буду благодарен пополнению этого списка :-)
СКажу немного подробнее:
XDrawChem-двумерная рисовалка, но вообще у нее единственный плюс- русскоязычный интерфейс. А вообще — двойные связи сливаются и выглядят почти как одинарные, так что держу её только для полноты коллекции.
JChempaint- тоже не очень-то мне нравится.
Лучшая из двумерных рисовалок — Chemiool. Можно полученные формулы с помощью пакета Openbabel отконвертировать в какой-либо трёхмерный формат (например, в .gpr) и открыть с помощью того же просмотровщика Jmol (бесплатная химическая смотрелка, в дистрибутиве есть три «пусковых» файла под самые главные операционные системы) но, опять же,пока создашь трехмерную модель «без косяков» (вроде лишних атомов водорода и т.п.) потратишь несколько попыток.
Ghemical — программа для трехмерного моделирования по химии. Хотя созданные ей файлы с помощью Jmol я открыть не смог (хотя, как я уже сказал, если в этот формат конвертировать файлы, созданные Chemiool, проблем с их открытием не будет (возможно, виноваты кривые руки и незнание английского)).
Marvin- проприетарная программа, разрабатываемая ChemAxon. Для скачивания нужна регистрация (лучше скачивать чисто линуксовую версию). Можно делать двумерные формулы, можно трёхмерные (опять же, я открываю их в основном Jmol, он мне больше нравится, хотя там есть и свой просмотровщик).
Chimera — это программа не столько химическая, сколько биохимическая (предназначена для просмотра молекул белков, ДНК и т.д.)
Отлично :-)
Спасибо! Когда каталог софта обновлять будем, добавлю вашу информацию.